巴里坤湿地主要是指巴里坤湖及其周边水草资源相对丰富茂盛、地下水位较高和季节性积水的低湿地。包括河流湿地、湖泊湿地、沼泽湿地和人工湿地（水库、耕地）四类。是巴里坤盆地人类生产生活的主要保护屏障，为更好的保护湿地资源，巴里坤县采取了以下举措：

一是把湿地保护列入重要议事日程，立了专门的保护机构-巴里坤湖湿地保护管理站，加强保护工作。

二是编制了《新疆巴里坤湖湿地保护与恢复项目可行性研究报告》，并报国家林业局、自治区发展与改革委员会批准立项实施。

三是严格控制在上游打井、修水库，保障水源不被截留。
　 四是科学预测天气情况，加强人工降雨，开展向巴里坤湖补水工作。
　五是严格控制湿地周边土地开发，保持水土平衡。
　六是严格控制高耗水、重污染项目的建设，加强生态环境保护。
　七是加强湿地周边污染企业的治理，特别是严格控制化工企业废水、废渣、烟尘的排放，减少污染，降低温室效应。　　

八是加速城市生活污水处理、垃圾处理项目的建设步伐，建设污水处理厂，实现水资源的重复利用。

九是在巴里坤县城集中供热，淘汰各种类型的小锅炉，提高空气质量。