2012年5月13日，中德合作湿地生物多样性保护项目仙山湖国家湿地公园生态系统评估圆满完成，历时10天。项目在德国林业服务公司自然资源管理专家Dr. Marta TRESKONOVA(玛塔博士)、 浙江省林业厅森林资源处俞肖剑副调研员，浙江省林科院植物专家朱锦茹研究员，宋绪忠博士，湖州师范学院副院长、鱼类专家叶金云教授等人员的共同努力下，通过人员培训、野外数据采集、数据分析和解读、推导评估结果、生态系统模型的建立，顺利的完成了仙山湖国家湿地公园生态系统评估工作。

此次评估利用德国先进的梯度和聚类分析对仙山湖湿地类型进行分类以及确认生态演化（变）趋势。确定仙山湖湿地公园的湿地和树林类型10项，确立了仙山湖生态系统的条件，并提出了科学的建议和意见。目前仙山湖自然的湿地面积很少且呈片段化，生态系统服务非常有限。在现有的条件下，仙山湖湿地公园的湿地生态系统的长期生存前景不容乐观，因此必须将生态学原理作用于经济发展和环境保护。对现有划分的各功能区进行重新审核，确保能在经济发展和生态保护之间达到最佳平衡。