近年来，由于气候变干和人类活动的双重影响，高原湿地面积不断缩减，萎缩症病情在逐年加重，不见好转。

蒙新高原上的湖泊湿地缩减趋势明显。博斯腾湖的湖泊水位在 1956 年时曾为1048.34m，而到 1988 年时则下降到 1045.21m，32 年中湖水水位下降了 3.13 m。博斯腾湖原来的芦苇资源十分丰富，1959 年的芦苇面积可达 5.58 万 hm²，蕴藏量约405.58万吨， 居全国四大湖苇区储量之首， 由于湖泊萎缩， 水位下降， 芦苇大面积衰亡，到 1993 年芦苇面积仅剩 2.77 万 hm²，蕴藏量也降至 265.58 万吨。艾比湖的湖泊面积在近 40 年中减少了一半，由 1950 年的 1070km²缩减至1987 年的 500km²。我国湖面海拔最低的湖泊——艾丁湖在 20 世纪 50 年代初的面积为 124km²，60 年代中期尚有23km²，而至 80 年代中后期湖泊水面仅剩 5km²，接近消亡的边缘。岱海自 60 年代末以来水位持续下降，1970 ～1995 年期间水位下降 3.85m，湖泊面积也由 160km²缩减至109km²。居延海是中国历史上著名的游移湖泊，后分为东居延海和西居延海，1958 年航空像片显示东西居延海当时的面积分别为 35.5km²和 26.7km²；但至 1961 年西居延海则完全干涸，在此期间东居延海也曾经出现过多次干涸现象，1994 年又一次干涸，直至现在仍处于枯水状态。青藏高原区域内的青海湖湿地水位自1908 ～ 1957 年从 3205m 下降至 3196.57m，平均每年下降17.2cm， 水面面积减少了8.4 km²。从 1957 ～ 1988 年湖水水位平均每年下降约10cm，湖水含盐量逐年上升。鸟岛、尕海和洱海相继脱离母体成为子湖。1988～2000年的12年间水位又降低了0.39m，平均每年降低0.03m。青海湖自 1908 ～ 2000 年内水位共降低了11.27m。1985 年若尔盖高原牧区的 16 个湖泊，总面积 2215hm²，15 年之后有 5 个全部干涸，其余 11 个也有不同程度的萎缩，总面积仅剩下l323hm²，水面减少892hm²，减幅达 40.3％，平均每年减少 59.5hm²，其平均递减速度达3.35％。近 40 年来青海湖流域年平均入湖流量也呈减少趋势，尤其是 20 世纪 90 年代以来减少更为显著。这是由于青海湖水位的升降主要取决于入湖流量、湖面降水量和蒸发量。其中，入湖流量作为青海湖水量的主要来源，对湖泊水位的变化有着显著的影响 。

青藏高原上的许多其他湖泊也发生了非常显著的萎缩现象。如米提江占木错和乌兰拉湖现都已经分离为几个小湖泊；苟仁错在 20 世纪60 年代曾是一个咸水湖，到 80 年代演变成一个面积为 23.5km²的盐湖，目前仅有少量存水，几乎干涸，演变为干盐湖；乃日平错湖萎缩的印证还历历在目，沿岸还有一些残留的小湖泊，追古论今，该湖的水位已经下降了约 20m，湖面面积缩小了近 2/3；万泉错湖沿岸残留着多条砂堤，湖泊萎缩的痕迹清晰可见，该湖湖面到目前为止已经下降了近 48m，其湖面面积也只有原来的 1/10，湖滨地区残留了许多小湖，面积在 2km²以下的就有 27 个；龙木错湖退化迹象更加明显，湖滨残留的砂堤多达 70 多条，在湖泊东部的湖滨地区残留的砂堤在 100 条以上，许多湖岸线的高程已经显著高出现存湖面，最高的高程差高达 150 ～ 160m。黄河源区的两大淡水湖——扎陵湖和鄂陵湖近几十年来也发生了明显的退化，退化的痕迹依稀可见。