自2008年10月中下旬以来，由于上游流域降水与水库泄流的影响，洞庭湖遭遇了有历史水位记录以来罕见的冬季水位迅猛上涨情况，不到2周的时间内从22.70米上涨到29.75米，给洞庭湖湿地特别是刚刚南下的越冬候鸟造成了严重影响。

　　据城陵矶水文站资料，自2008年10月31日至11月12日，城陵矶水位从22.70米迅速上涨至29.75米（洞庭湖警戒水位32.5米），13天内涨了7.05米。东洞庭湖越冬候鸟以及麋鹿等物种取食和栖息的草滩、泥滩悉数被淹（根据东洞庭湖自然保护区历史调查资料，最适宜保护区内鸟类栖息的水位为24—25米）。由于水位上涨，越冬候鸟和麋鹿的栖息地遭受到严重影响。麋鹿和大部鸟类不得不逃逸到东洞庭湖周边的农田、旱地及内湖等区域觅食和栖息。据调查结果显示，除罗纹鸭喜居在洞庭湖自然水域外， 95%的雁类、鹤类、天鹅和几乎所有的涉禽都迁移到了社区农田及内湖。尤其是岳阳县麻塘镇和建新农场，两处不到4000亩的水稻田内，聚集了近30000只5种雁类栖息。另，11月9日和11月12日，有2起举报在君山公园和君山区发现麋鹿遭受轰赶的事件，现场采集到了麋鹿毛和擦伤的血迹标本。

　　鸟类面临食物短缺的生存危机。11月中上旬，是冬候鸟经过长途迁徙至东洞庭湖后急需补充能量的重要时期，这段时期食物馈泛，对越冬候鸟而言将是致命打击。社区农作物遭受较大损失。11月12日的调查中，目前新播种的油菜、冬小麦以及稻田中新生的杂草成为雁类的主要食物，仅春风站附近就约20亩小麦被雁类取食干净。鸟类和麋鹿向社区农田迁移，特别是有些迁移区为人类活动较多的区域，在给它们生存造成威胁的同时，也给保护区的巡护管理带来了巨大的压力。候鸟与人的距离太近。小区域内鸟类高密度集中，极易发生中毒事件，同时，由于体力下降，食物减少，候鸟的发病率会有所上升，雁类和鸭类与家禽家畜完全混群，对疫源疫病的控制十分不利。11月17日，已经在稻田集中发现了1只白额雁、6只小白额雁和2只赤麻鸭死亡现象，目前正在检测之中，饿死、病死的可能性都存在。同时，保护区已经接到多起人与麋鹿冲突、网捕和准备毒杀的信息，保护区巡护监测的压力巨大。

　　针对以上情况和可能带来的威胁，保护区已经采取了以下多项措施加以应对。

　　1、深入开展调查。根据鸟类对不同栖息地的需求，在保护区周边的华容县、君山区、建新农场、岳阳县等东洞庭湖的外围区域，开展了大范围的鸟类调查，基本摸清了目前非常规水位下鸟类的集中栖息区域，为进一步开展鸟类的保护与救护工作奠定了基础。

　　2、加强系统宣传。通过湖南经视、岳阳电视台、三湘都市报等媒体，向公众反映目前洞庭湖鸟类受到威胁的现状，引导公众保护鸟类。同时，向社区群众分发了《野生动物保护法》《自然保护区条例》等宣传资料，并发放到农村有关学校学生手中，号召公众关爱处于困境中的鸟类。播发有关通告，针对鸟类由于食物馈泛而取食农作物给农户造成损失的情况，保护区组织各站工作人员对广大农户开展政策宣传，并对个别特殊情况开展了说服工作。

　　3、开展护鸟行动。湖南省林业厅、岳阳市林业局和东洞庭湖自然保护区都在第一时间给各野外管理机构下发了《关于加强巡护管理和宣传等工作的紧急通知》。要求各单位在目前非常规水位下，加强对鸟类集中分布区的监测、巡护管理和针对社区群众的宣传等工作，在监测日报制的基础上实时了解鸟类的生存与健康状况；结合国家林业局“候鸟三号”行动，东洞庭湖自然保护区派出所和岳阳县森林分局在岳阳市林业局森林分局的领导下启动了针对非法毒鸟、捕鸟的专项打击行动。

　　4、适度的开展人工投食。由于洞庭湖水位从29.75米回落到28.22米经历了近一周，继续回落到冬季正常水位的时间还比较长，且洲滩即使露出，苔草等水生植物在冬季的生长缓慢，需要很长时间才有可能恢复，鸟类食物短缺的现状必将是一个长期的过程。为了缓解因食物匮乏给鸟类带的生存威胁，保护区在鸟类相对集中的区域投食了稻谷和玉米，但经过一段时间的观察，效果并不理想。