2012年3月24日，保护区管理处下设的机动（环志）监测组正式启动了监测工作，该数据也从4月份开始上报全国疫源疫病监测网站。捕鱼港、团结沙、东旺沙等五个日常监测小组继续按要求开展日常监测和信息上报工作，4月份共监测到鸟类7目11科52种，共计43950只次，没有发现死亡鸟类或鸟类异常行为。

监测结果显示，4月份在保护区监测到的鸟类大多以鸻形目的鸻科和鹬科为主。数量为30390只次，占保护区同期水鸟数量的70%左右。其中数量最多的是黑腹滨鹬，数量达到了18667只次，占数量总数的42%，其次是银鸥，数量为2882只次。

机动（环志）监测组监测到的鸟类全部都是鸻形目的鸻科和鹬科，共计1目3科22种987只次。采集野生鸟类喉拭和肛拭样本11种共计100只次。

随着气温的逐步回升，雁鸭类在东滩保护区越冬的鸟类已渐渐离开，数量只有4504只次，只占保护区同期水鸟数量的10%左右。预计到5月份数量还将下降。