水生植物是邛海植物的主体，也是植物保护的重点。邛海水生植物组成了邛海的水生植被类型，可分为挺水植物群落、浮水植物群落和沉水植物群落三类。

一、挺水植物群落

1、芦苇群落（Form. Phragmites australis ）

芦苇为禾本科多年生具根状茎挺水草本，属本土优势物种。常形成单一优势种群落，群落下部常伴生有水蓼、茭草等植物，有时可与禾本科、莎草科和灯芯草科的在湖滨形成较为密集的沼生植物群落。

2、茭草群落（Form. Zizania latifolia）

菰，俗称茭草。菰群落主要为历史上人工种植后废弃而形成的。常形成单一优势种群落，在密集生长的群落内基本无伴生种，只是在根层不十分密集的地方或是群落边缘有少量的浮萍、凤眼莲、大薸、野菱、菹草、穗状狐尾藻以及湿生的水蓼、喜旱莲子草等伴生。

3、香蒲群落（Form. Typha orientalis）

该群落面积不大，只见于海河河口周边以及人工恢复的湿地浅水地带有小面积分布。群落下层结构的植物种类依立地条件而不同，浅水沼泽湿地多为湿生挺水植物，有芦苇、喜旱莲子草、尼泊尔酸模、茴茴蒜、紫茎泽兰等；在水体较深的地方通常还有沉水植物伴生，如金鱼藻、穗状狐尾藻等。

4、莲群落（Form. Nelumbo nucifera）

莲为莲科多年生具根状茎挺水草本。作为邛海湿地内人为引种栽培的植物之一， 莲常以单一优势种群构建成人工群落，下部水面伴生浮水植物浮萍、品藻、满江红等，边缘浅水区域常伴生有丁香蓼和少量禾本科、菊科的草本植物，主要在海门桥景区分布。

5、李氏禾、雀稗群落（Form. Leersia hexandra, Paspalum sp.）

李氏禾、雀稗群落主要分布于入湖溪流和河滨的浅水区域，以喜湿的草本植物占优，常见有李氏禾、雀稗、棒头草等较为常见，伴生有南国田字草、喜旱莲子草、满江红、野菱等。

6、长芒稗群落（Form. Echinochloa caudata）

长芒稗群落主要分布于入湖滨的浅水区域，以喜湿的草本植物占优，常见有长芒稗、雀稗、酸模叶蓼、棒头草等较为常见，伴生有南国田字草、满江红、 大薸、喜旱莲子草、野菱、石龙芮等。

7、酸模叶蓼群落（Form. Polygonum lapathifolium）

酸模叶蓼主要分布于入湖滨的浅水区域和入湖溪流和河道两侧。群落以蓼科的酸模叶蓼绝对占优，伴生有喜湿的草本植物，有长芒稗、雀稗、棒头草等、南国田字草、满江红、 大薸、喜旱莲子草、野菱、石龙芮等。

8、再力花群落 （Form. Thalia dealbata ）

再力花，又称水竹芋，是湿地公园建设过程中引进栽培的大型水生植物。由于是人工植被，群落结构较为简单。

二、浮水植物群落

1、莕菜群落（Form. Nymphoides peltatum）

莕菜为龙胆科 (Gentianaceae)多年生具根状茎浮水草本，属邛海原生物种。常伴生有沉水植物狐尾藻和眼子菜等。

2、野菱群落（Form. Trapa incisa）

野菱和菱（二角菱）二者均为菱科一年生浮水草本。野菱为邛海原生物种，常自然形成单一优势种群落，分布于邛海湖岸和湖湾浅水区或池塘内。二角菱是近年来引进的具有经济的植物，其生长势和竞争力均强于野菱。该类群落有时常伴生有金鱼草、菹草、浮萍等沉水或浮水植物。

3、睡莲群落（Form. Nymphaea tetragona）

睡莲为睡莲科多年生具根状茎浮水草本，为人工引种栽培植物，睡莲群落分布于观鸟岛湿地人工池塘。

4、凤眼莲群落（Form. Eichhornia crassipes）

凤眼莲又称水葫芦，原产南美洲，作为猪饲料引进栽培后，逸生。本群落常常形成单种群落，盖度常达100%，但在群落近岸部分常用一些水生植物生长，如大薸、喜旱莲子草、水蓼等在群落边缘伴生。

5、浮萍群落（Form.Lemna minor）

本群落主要分布于小海、海河河口以及入湖河道口避风湾道以及静水的池塘、浅水中。由于浮萍繁殖快，常在静水水面形成密布水面漂浮群落。常与紫萍混生。

6、大薸群落（Form. Pistia stratiotes）

大薸又称水白菜，适宜于平静的淡水池塘、沟渠中生长，是常见的水田杂草。常形成单种群落，或在没形成大面积群落时与浮萍、紫萍共生。已形成单优群落时，几无伴生种，只在群落边缘或与相临群落交界处有少量物种伴生，如喜旱莲子草、浮萍、紫萍、凤眼莲等。

7、浮叶眼子菜群落（Form. Potamogeton natans）

叶眼子菜为多年生草本。常形成单种优势群落。只在群落边缘处有少量伴生种，如浮萍、南国田字草、芦苇、菰、盒子草、穗状狐尾藻、满江红等。

8、空心莲子草群落（Form. Alternanthera philoxeroides）

喜旱莲子草又叫水花生、革命草，原产巴西，我国引种于北京、江苏、浙江、江西、湖南、福建等地，后逸为野生，属入侵物种。在邛海湖滨沼泽、湿地以及海河等河流岸边均有分布。常形成单种优势群落。只在群落边缘处有少量伴生种，如芦苇、菰、盒子草、穗状狐尾藻、满江红、浮萍、水蓼、石龙芮等。

9、水龙群落（Form. Ludwigia adscendens）

水龙是多年生具匍匐茎浮水草本，一年生，为柳叶菜科植物，属邛海湿地原生物种。该群落伴生有丁香蓼、美洲紫菀、喜旱莲子草、李氏禾、水蓼等，主要分布在湿地的浅水区及潮湿地带。

三、沉水植物群落

1、苦草群落（Form. Vallisneria natans）

苦草为水鳖科多年生具匍匐茎沉水草本，属邛海原生物种。苦草群落零星分布于湿地水深1 m左右的浅水区域。苦草植株叶长、翠绿、丛生，可作为风景区水景、庭院水池的优良水体绿化和观赏植物。

2、菹草、大茨藻群落（Form.Potamogeton crispus， Najas marina）

菹草为眼子菜科多年生具根状茎沉水草本。其与大茨藻常常一起形成群落。邛海原生的菹草、大茨藻群落，群落物种构成比较复杂，伴生物种较少。

3、狐尾藻群落（Form. Myriophyllum verticillatum）

狐尾藻为小二仙草科多年生具根状茎沉水草本，属邛海原生物种。

4、金鱼藻群落（Form. Ceratophyllum demersum）

金鱼藻为金鱼藻科多年生沉水草本，属邛海原生物种。